◎新冠疫情仍處於流行期，且死亡病例數上升，請尚未完成JN.1 疫苗接種民眾儘速接種，以獲得充足保護力，降低感染後併發重症及死亡風險。 發布日期：2025-06-17
疾管署今(17)日表示，國內新冠疫情略降，惟仍處相對高點，且死亡病例數持續上升，提醒民眾不可掉以輕心，出入醫療照護機構、搭乘大眾運輸、至人潮擁擠室內場所，建議自主佩戴口罩；如有生病建議儘量在家休息，避免不必要的外出，外出時記得佩戴口罩，另具重症風險因子的民眾如出現疑似症狀應儘速就醫，以利醫師及早診治並開立抗病毒藥物。國內目前主流變異株為NB.1.8.1。全球新冠病毒陽性率於近期呈上升趨勢，除非洲以外，各區域皆呈上升趨勢，流行變異株以LP.8.1占比最高，NB.1.8.1占比次高；日本及孟加拉疫情上升，中國、香港疫情經高峰後呈下降趨勢，另中國、香港及日本流行變異株皆以NB.1.8.1為多。
國內新冠JN.1疫苗已累計接種235.3萬人次，目前全國JN.1疫苗接種率9.48%，65歲以上接種率分別為第1劑19.56%、第2劑1.98%，國內疫情仍處流行高峰，本土確定及死亡個案均有8成以上未接種JN.1疫苗，呼籲65歲以上長者等3類高風險對象，已接種過1劑JN.1疫苗且間隔達2個月(60天)者，應儘速接種第2劑，降低重症或死亡發生風險，提醒民眾別因疫情略降而掉以輕心，疾病威脅仍持續，請年齡滿6個月以上且尚未接種民眾儘早接種。
◎國內新增3例境外移入瘧疾病例，民眾如赴非洲等瘧疾流行地區，請提前4-6週至旅遊醫學門診諮詢接種疫苗及領取預防性用藥。 發布日期：2025-06-17
疾管署今(17)日公布國內新增3例境外移入瘧疾病例，為年齡介於40多歲至50多歲本國籍男性，4月下旬至5月下旬期間分別具貝南、肯亞旅遊史，5月底至6月初發病，6月中就醫，經診斷3人均為惡性瘧重症個案。目前3名個案持續住院治療中，衛生單位將持續追蹤個案健康狀況及後續檢驗結果。
疾管署監測資料顯示，近19年(2007-2025)累計198例確定病例，均為境外移入，感染地區以非洲國家為多，檢出病原體以惡性瘧為主，其次為間日瘧。
◎因應新生兒腸病毒疫情，疾管署成立應變工作小組，呼籲民眾做好新生兒腸病毒流行期間各項防護措施。 發布日期：2025-06-17
疾管署今(17)日表示，國內新生兒腸病毒疫情嚴峻，持續有新生兒感染引發重症或死亡病例發生，今(2025)年累計7例腸病毒感染併發重症確定病例中，5例為新生兒感染伊科病毒11型，且造成4例死亡。該型別病毒感染新生兒後病情常較為嚴重，疾管署呼籲新生兒腸病毒流行期間，如家中有新生兒，建議儘量謝絕訪客、親朋好友對新生兒勿抱抱親親，以免造成傳染。
◎國內出現今年首例日本腦炎病例，請民眾落實防蚊措施，按時攜帶家中幼兒接種日本腦炎疫苗。 發布日期：2025-06-16
疾管署今(16)日公布國內今年首例日本腦炎確定病例，為嘉義縣大林鎮50多歲男性，目前持續住院治療中。個案同住家人均無疑似症狀，住家附近有水稻田、溝渠、豬舍等高風險場域，平日從事畜牧業工作，住家附近及工作場域附近之感染可能性均無法排除。疾管署監測資料顯示，臺灣每年5至10月為日本腦炎流行季，其中6至7月為流行高峰，以40歲以上成人較多，惟各年齡層都有感染風險，提醒民眾應提高警覺，不可掉以輕心。
◎愛滋自我篩檢試劑明起為期10天免運費小確幸，陪你迎接鳳凰花開的幸福夏日。 發布日期：2025-06-12
疾管署今(12)日表示，暑假即將到來，為鼓勵年輕族群接受愛滋篩檢，疾管署推出愛滋自我篩檢試劑推廣活動，自明(13)日凌晨零時起至6月22日午夜23時59分止，活動期間每日前500筆訂單(每筆上限為2劑)均可享免運，民眾可透過愛滋自我篩檢計畫網站 (https://hiva.cdc.gov.tw/Selftest/)訂購自我篩檢試劑，並選擇鄰近超商通路(7-ELEVEN或全家)取貨付款，不需額外支付45元物流費，即可取得篩檢試劑，一起讓夏天成為健康幸福的季節。。