本院於民國46年7月1日創立，原名「臺灣永康榮民醫院」係由臺灣省衛生處代管。
於民國47年改棣「行政院國軍退除役官兵就業輔導委員會」成立之初為「慢性病療養醫院」。
於民國48年5月1日經輔導會指定為南部地區重點治療醫院並於55年10月4日改銜為「行政院國軍退除役官兵輔導委員會永康榮民醫院」。
民國85年結合社會善心人士，藉由服務過程提供志願服務的志工，一份更廣闊的視野與服務人生觀，並共同奉獻心力服務大眾，於當年7月1日，成立「康榮志工隊」。
為因應榮民醫療體系組織整合，於101年1月1日與高雄榮民總醫院完成垂直整合改制改名為「高雄榮民總醫院臺南分院」的現有全方位醫療照護〈急性、慢性、長期照護、居家護理、安寧共照〉之基礎，整體目標朝向「溫馨、精緻、優質」之健康照護園區發展。
「康榮志工隊」配合改制於同年更名為「高雄榮總臺南分院志工隊」。