為提升為民服務及施政品質，增進行政效能，國軍退除役官兵輔導委員會依據當年度施政計畫、中程施政計畫、所訂策略績效目標及重要施政計畫項目與其他足以代表單位業務職掌及承辦之重點工作及總統、院長重要政策宣示，院長及主任委員交辦或指示事項，特訂定國軍退除役官兵輔導委員會及所屬機構團體績效評核作業規定。
高雄榮民總醫院臺南分院每年配合國軍退除役官兵輔導委員會所屬醫療機構工作績效評核指標監測，並於每季召開醫療品質暨病人安全審議委員會進行指標檢討，針對超出監測值外的指標項目進行原因分析及改善措施，持續追蹤成效，並留有會議紀錄備查。
高雄榮民總醫院臺南分院每年配合國軍退除役官兵輔導委員會所屬醫療機構工作績效評核指標監測，並於每季召開醫療品質暨病人安全審議委員會進行指標檢討，針對超出監測值外的指標項目進行原因分析及改善措施，持續追蹤成效，並留有會議紀錄備查。
指標以醫院收集資料為主，依據全民健康保險醫療品質資訊公開網資料及各院所每月定期回報國軍退除役官兵輔導委員會立法院預算中心數據定義之數據；高雄榮民總醫院臺南分院依規訂定檢討改善機制，於每年呈附檢討改善佐證資料。